在使用過程中，反滲透膜元件會受到在給水中可能存在的懸浮物質或難溶物質的污染，這些污染物中最常見的為碳酸鈣垢、硫酸鈣垢、金屬氧化物垢、硅沉積物及有機或生物沉積物。 污染物的性質及污染速度與給水條件有關，污染是慢慢發展的，如果不早期采取措施，污染將會在相對短的時間內損壞膜元件的性能。 

    反滲透膜的清洗方法：

1、沖洗反滲透膜組件，排除運行過程中的污水和給水通道中的污染物。

2、使用反滲透產水，按清洗配方的要求配制反滲透清洗劑，并混合均勻；調節清洗液的pH值、溫度至規定的范圍內。

3、將反滲透清洗劑引入膜組件循環清洗約lh，在此過程中應注意要調節清洗液流量，使流量緩慢增加，防止清洗出的污染物將給水通道堵塞。在排掉最初排出的約20％已污染的清洗劑后，將清洗劑及滲出的少量產品水再循環至清洗箱。當pH值變化超過0.5時，應重新調整至目標值。

4、浸泡和再循環(可選擇步驟)。浸泡時間通常為1～12h(根據具體污染物的情況定，原則上應盡量減少化學試劑和膜的接觸時間)，在進行較長時間浸泡時，應注意保持正確的溫度(可保持10％流量循環)。

5、用反滲透產品水進行低壓沖洗，除去在清洗系統和反滲透系統中的所有殘存2品。

6、按投運步驟重新將反滲透裝置投運。應注意在進行清洗后，反滲透產水水質要數小時甚至幾天才能穩定下來，尤其在經過高pH值清洗液清洗后。